那时，太子朱标尚在世，而蓝玉因与朱标之妻有着亲缘关系，故而二人时常走动，相处颇为融洽。
曾有一回，蓝玉率领大军凯旋而归，朱标特意在东宫设宴，为其接风洗尘并庆贺战功。就在这宴席之间，蓝玉面色凝重地告诉朱标：“我此番出征，途径封国之时，留意观察了燕王朱棣一番。他那举手投足间的姿态和做派，简直与当今圣上毫无二致！”
接着，他又压低声音道：“而且，我暗中派人观望朱棣，发现他身上竟隐隐透着天子之气，殿下您可得对此人多留个心眼儿，务必小心提防啊！”
然而，朱标听完这番话语后，只是微微一笑，不以为意地说道：“四弟朱棣平日里对我甚是恭敬，我实在看不出他有丝毫谋逆之心。”
可谁能料到，后来发生之事竟是如此出人意料。蓝玉这次所言竟然成真，只不过燕王朱棣虽未造朱标的反，但最终还是起兵反叛，造了朱标之子建文帝的反。倘若当初朱标能够听信蓝玉之言，对朱棣有所戒备，或许就不会有后面永乐大帝朱棣的登场了。
时光荏苒，转眼间便到了洪武二十五年四月。令人悲痛欲绝的是，皇太子朱标突染恶疾，医治无效，最终不幸薨逝。
此后，朱棣在那位神秘的黑衣妖僧姚广孝的教唆之下，向朱元璋呈上奏折，字里行间明里暗里地暗示着，像蓝玉这样勇猛善战的将领们如今在朝堂之上位高权重，如果不尽早加以抑制，日后必定会酿成大祸。
然而，蓝玉等人依旧我行我素、桀骜不驯，他们全然没有察觉到朱标突然薨逝这件事已经悄然改变了朝政局势。此时的朱元璋心中已经萌生出再次掀起一场大狱来铲除功臣的念头。
洪武二十五年九月，朱元璋正式册封朱允炆为皇太孙，但与此同时，仍任命蓝玉担任太孙太傅，以此显示对他的恩宠有加。可是，蓝玉对于这个安排却是满心的不满，只因宋国公冯胜以及颖国公傅有德二人皆被封为太师之职，而自己却未能获得此等殊荣。于是乎，在某一次的酒局当中，蓝玉趁着酒兴大发，口不择言地抱怨起来：“吾不堪太师也！！！”